takara测序发给我的结果,包含三个文件,除了两个双向测序的结果以外,还有一个特别短的是什么?双向测序的各标注着P1,P2,特别短的那个标注着R1,长度跟我预计的不一致,还要自己拼接吗?怎么拼_作业帮
takara测序发给我的结果,包含三个文件,除了两个双向测序的结果以外,还有一个特别短的是什么?双向测序的各标注着P1,P2,特别短的那个标注着R1,长度跟我预计的不一致,还要自己拼接吗?怎么拼
takara测序发给我的结果,包含三个文件,除了两个双向测序的结果以外,还有一个特别短的是什么?双向测序的各标注着P1,P2,特别短的那个标注着R1,长度跟我预计的不一致,还要自己拼接吗?怎么拼接?
最准确的方法,你可以将测序结果放到相关的软件Sequencher里面分析,比对就OK啦.不过通过你的表述,我个人觉得PCR产物较长或者克隆片段较长的可能性比较大,一个反应测不通,就会采用双向测序的方法,即两头测.由于测序反应一次读取的长度有限,有可能两头测也没有测通,然后你说的测序公司会根据已经得到的测序结果再次设计引物,进行测序,最后测通.两头的测序结果就可能是P1和P2,那么剩余中间的测序结果为R1.说的不一定对,最好还是和测序公司联系一下吧.
我估计那个R1就是自动生成的P1和P2的拼接产物，但是有错配，导致拼接中断，所以特别短。还有一种可能，R1是P1和P2的重叠区。详细情况也可以询问TAKARA测序部的服务中心。自己拼接的话，需要把其中一条序列反向互补处理，然后两条序列比对（alignment），然后重叠区加上各自头尾（5‘和3’）端的一段，就是完整的序列了。注：片段不太长的话（<700bp），我一般不...华测使用手册&#x2d;精品版
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