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【求助】急急急，求助各位统计学高手，这些数据应该怎么分析？ two way ANOVA是什么统计方法，然后还要怎么post-hoc tests
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这个帖子发布于5年零30天前，其中的信息可能已发生改变或有所发展。
各位统计学高手，这些数据应该怎么分析？我起初用的非参数进行的统计分析，后来投稿后reviewer的意见说如下：This data should have first been analysed by 2 way ANOVA, then post-hoc tests performed。 two way ANOVA是什么统计方法，然后还要怎么post-hoc tests ？由于要很快回复这些意见，在此求助各位统计学高手帮忙给分析，不胜感激！
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山水约定 从数据猜测，你的试验应该是双因素等重复设计，应该做双因素析因方差分析。因此你原来的统计方法是错误的。（你真走运，统计方法用错居然还没被退，这审稿人不错，表扬一下！）双因素方差分析，又叫双向方差分析，即你贴子里的two way ANOVA看你统计真的不是太懂，就再给你当回雷锋吧：你的试验设计应该是这样的：A因素：处理方法因素，共有3个处理水平：方法1，方法2，不处理B因素：观测时间因素，也是3个因素水平：0周，1周，2周AB因素各水平上重复数为4，即4只动物参加试验。如果/假设，第1、2、3、4只动物不是相同的种类和性质，并且5、6、7、8 和 9、10、11、12分别是对应于1、2、3、4只。那你这动物就是4个区组，每区组有3只。这就构成嵌套设计，应该进行双因素嵌套裂区的方差分析。并且依我看：时间因素是主因素，应该设置于大区，即B区。处理因素是辅因素，应该设置于小区，即A区。A区下再设置4个区组。(当然这个“如果/假设”可能性不大。要真是有这个“如果/假设”，你的统计就更复杂了，文章也会更有意思了)我还是不太明白，首先做two way ANOVA分析的目的是什么呢？
如果我只是比较某一个时间的两组动物间的反应数值是否有变化，或者只是比较某一组的两个时间的反应数值是否有变化，还有必要做two way ANOVA分析吗？我还是觉得直接进行非参数分析就可以了。。。
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two way ANOVA的目的是什么？
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多谢 山水约定战友的热心帮助，继续求助。 下面这句话什么意思？These data should have first been analysed by one-way ANOVA, if the data were normally distributed, followed by a post-hoc test such as Tukey's; or if the data were not normally distributed, by a Kruskal Wallis test followed by Mann-Whitney U-tests with a Bonferonni correction.
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one-way ANOVA是用来分析数据是否是正态分布吗？做实验得到数据后 是否都要先进行下one way ANOVA或者two way ANOVA，然后再进行多重比较？
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再次请教各位统计学高手，我有一组数据，要比较不同时间点的组间差异。请问应该用哪种方法呢？ 多谢了！
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从数据猜测，你的试验应该是双因素等重复设计，应该做双因素析因方差分析。因此你原来的统计方法是错误的。（你真走运，统计方法用错居然还没被退，这审稿人不错，表扬一下！）双因素方差分析，又叫双向方差分析，即你贴子里的two way ANOVA看你统计真的不是太懂，就再给你当回雷锋吧：你的试验设计应该是这样的：A因素：处理方法因素，共有3个处理水平：方法1，方法2，不处理B因素：观测时间因素，也是3个因素水平：0周，1周，2周AB因素各水平上重复数为4，即4只动物参加试验。如果/假设，第1、2、3、4只动物不是相同的种类和性质，并且5、6、7、8 和 9、10、11、12分别是对应于1、2、3、4只。那你这动物就是4个区组，每区组有3只。这就构成嵌套设计，应该进行双因素嵌套裂区的方差分析。并且依我看：时间因素是主因素，应该设置于大区，即B区。处理因素是辅因素，应该设置于小区，即A区。A区下再设置4个区组。(当然这个“如果/假设”可能性不大。要真是有这个“如果/假设”，你的统计就更复杂了，文章也会更有意思了)
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从数据猜测，你的试验应该是双因素等重复设计，应该做双因素析因方差分析。因此你原来的统计方法是错误的。（你真走运，统计方法用错居然还没被退，这审稿人不错，表扬一下！）双因素方差分析，又叫双向方差分析，即你贴子里的two way ANOVA看你统计真的不是太懂，就再给你当回雷锋吧：你的试验设计应该是这样的：A因素：处理方法因素，共有3个处理水平：方法1，方法2，不处理B因素：观测时间因素，也是3个因素水平：0周，1周，2周AB因素各水平上重复数为4，即4只动物参加试验。如果/假设，第1、2、3、4只动物不是相同的种类和性质，并且5、6、7、8 和 9、10、11、12分别是对应于1、2、3、4只。那你这动物就是4个区组，每区组有3只。这就构成嵌套设计，应该进行双因素嵌套裂区的方差分析。并且依我看：时间因素是主因素，应该设置于大区，即B区。处理因素是辅因素，应该设置于小区，即A区。A区下再设置4个区组。(当然这个“如果/假设”可能性不大。要真是有这个“如果/假设”，你的统计就更复杂了，文章也会更有意思了)
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然后还要怎么post-hoc tests-----这个我不太明白审稿人要说什么？是不是要作者方差分析之后再做一个分析过程：多重比较？趋势分析？一般来说是应该做的。例如多重比较：作者在进行方差分析后（严谨地讲是整体性方差分析），肯定要做多重比较的，看A、B两因素的各水平间究竟有哪些是显著性的差异，差异有多大。至于趋势分析，楼主就3个时点，不必折腾了。所以我猜，审稿人就是想叫你此后再做一下多重比较吧
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多重比较怎么做，楼主你得学习了。这里不是统计教程，不能什么都教会你的
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好人做到底，雷锋到吐血那就帮你做一个两因素析因方差分析看下贴的图
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首先，你的数据要这样摆
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然后，做两因素析因方差分析这是交互作用图
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之后，应该做一套完整的多重比较。下面选用LSD法和HSD法做多重比较：
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多重比较似乎都没有显著性。但是且慢：以LSD法来看：A2与A3比较，P≈0.05，可以认为差异有显著性！（多重比较时，其界值可以适当变化，因此0.05附近的概率绝对算小概率了！！就把这句话原样写进论文）B3与B1，B2与B1，都是很小的概率。同理，可以认为有显著性差异。
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多谢“山水约定”的热心帮助啊！！！
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山水约定 从数据猜测，你的试验应该是双因素等重复设计，应该做双因素析因方差分析。因此你原来的统计方法是错误的。（你真走运，统计方法用错居然还没被退，这审稿人不错，表扬一下！）双因素方差分析，又叫双向方差分析，即你贴子里的two way ANOVA看你统计真的不是太懂，就再给你当回雷锋吧：你的试验设计应该是这样的：A因素：处理方法因素，共有3个处理水平：方法1，方法2，不处理B因素：观测时间因素，也是3个因素水平：0周，1周，2周AB因素各水平上重复数为4，即4只动物参加试验。如果/假设，第1、2、3、4只动物不是相同的种类和性质，并且5、6、7、8 和 9、10、11、12分别是对应于1、2、3、4只。那你这动物就是4个区组，每区组有3只。这就构成嵌套设计，应该进行双因素嵌套裂区的方差分析。并且依我看：时间因素是主因素，应该设置于大区，即B区。处理因素是辅因素，应该设置于小区，即A区。A区下再设置4个区组。(当然这个“如果/假设”可能性不大。要真是有这个“如果/假设”，你的统计就更复杂了，文章也会更有意思了)我还是不太明白，首先做two way ANOVA分析的目的是什么呢？
如果我只是比较某一个时间的两组动物间的反应数值是否有变化，或者只是比较某一组的两个时间的反应数值是否有变化，还有必要做two way ANOVA分析吗？我还是觉得直接进行非参数分析就可以了。。。
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多组多因素的试验，就是不允许你一一做两组间的比较，那会有较大的统计错误风险。理论么我就不说了，你看下方差分析专著吧。这不是用不用非参分析的事，而是你的统计概念有问题了呵呵
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这么说吧：因为你做的是一个多因素相互影响的试验，不能把它们分裂开来一一分析比较。这就是统计风险的概念了
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专家提的问题就是这个：This data should have first been analysed by 2 way ANOVA
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two way ANOVA的目的是什么？
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两个因素之间的影响，各因素各水平之间的影响，做综合分析
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“如果我只是比较某一个时间的两组动物间的反应数值是否有变化”----这相当于把时间因素割裂开来“，或者只是比较某一组的两个时间的反应数值是否有变化”----这相当于把组别因素割裂开
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当然我们也需要做割裂开的分析，这就是后面的多重分析但是这里的多重分析，考虑了割裂后的影响（例如在检验界值的考虑上就有），这绝对不同于你曾经做过的检验
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还有，非参检验是解决数据偏态的问题。你现在的问题是统计方法有误，不是非参不非参的事
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再多说一点：方差分析对一般偏态很“耐受”，所以后面你不一定需要做非参检验
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山水约定同学实在是活雷锋啊！而且，此例对我这样的人无疑是一个很好的教材，mark下，仔细学习
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山水约定同学对统计学理解真透啊，希望有机会跟您学习学习，我现在正在看生物统计方面的书，不知道可否推荐一下，
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多谢 山水约定战友的热心帮助，继续求助。 下面这句话什么意思？These data should have first been analysed by one-way ANOVA, if the data were normally distributed, followed by a post-hoc test such as Tukey's; or if the data were not normally distributed, by a Kruskal Wallis test followed by Mann-Whitney U-tests with a Bonferonni correction.
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山水约定真是好人啊，以后多向你学习了
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one-way ANOVA是用来分析数据是否是正态分布吗？做实验得到数据后 是否都要先进行下one way ANOVA或者two way ANOVA，然后再进行多重比较？
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biosun one-way ANOVA是用来分析数据是否是正态分布吗？做实验得到数据后 是否都要先进行下one way ANOVA或者two way ANOVA，然后再进行多重比较？one-way ANOVA是用来分析数据是否是正态分布吗？------不是那个意思。方差分析就是对方差进行分析。一般就是面对计量性质的资料。举个简单的例子：比如两组试验数据，每组都有若干个重复测定值。我们按一定方法计算各组内的方差（这好算的，按公式计算就是）和各组间的方差甚至是组间和处理间及叉作用的方差。如果我们发现组内的方差很大，这可以认为重复试验的误差比较大，试验的精密度不好更如果组内的方差甚至比组间的方差都大，你说，能认为组间有差异吗？不能。因为表面上看来有差异，其实可能是组内的差异在影响。方差分析就基于这个思想，按一定的统计检验水准，来判定两组间的差异究竟是“真”差异（两组差异）还是“假”差异（受组内变异影响所致）两组间的t检验大家很常用，其实它的检验思路和方差分析密切相关。
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biosun one-way ANOVA是用来分析数据是否是正态分布吗？做实验得到数据后 是否都要先进行下one way ANOVA或者two way ANOVA，然后再进行多重比较？做实验得到数据后 是否都要先进行下one way ANOVA或者two way ANOVA，然后再进行多重比较？------如果你的计量数据资料涉及到多组，一般都应进行方差分析。组数再多，却是一个因素，那就是单因素方差分析one way ANOVA若有两个因素，那就是双因素方差分析two way ANOVA而两组间的t检验，只能检验单因素并且只有两个处理水平（也就是两个组）这样一 最简单的试验设计资料。所以，它根本不似方差检验那样有效的。完整的方差分析要包括3-4步内容：⑴整体综合性方差分析。大概这就是方差分析的主要内容。⑵多重比较。因为整体分析只能看整体情况，还需要细细分析。所以多重比较已成为方初分析的必不可少的一步！并且多重比较的方法应选2个以上，各方法有各自特点，互为参考。⑶交互作用图。当然没有交互作用分析的资料就不要这个了。⑷如果其中某因素是时间因素，还可考虑作趋势分析。做方差分析当然希望数据正态。因此检查正态性是必要的。但是看资料要求不同，对正态性的要求程度也可以灵活的。严重偏态的数据可以考虑转换数据和采用非参检验
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biosun 再次请教各位统计学高手，我有一组数据，要比较不同时间点的组间差异。请问应该用哪种方法呢？ 多谢了！do week=0,2, 4,
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biosun 多谢 山水约定战友的热心帮助，继续求助。 下面这句话什么意思？These data should have first been analysed by one-way ANOVA, if the data were normally distributed, followed by a post-hoc test such as Tukey's; or if the data were not normally distributed, by a Kruskal Wallis test followed by Mann-Whitney U-tests with a Bonferonni correction.这一段真是金玉良言啊~
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山水约定真是学的很透彻啊，我想问下你用的是什么统计分析软件，谢谢
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重复测量的方法，应该可以
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山水约定讲得很好啊，先标记一下！
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