求文件格式转换转换格式大神

E3结束了,还有ChinaJoy
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届时,让我们一同关注台湾首家苹果零售店的开业盛况吧。
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作为经常获奖的摄影师,这也是Yeo Yeow Kwang第一次获得用手机拍照方面的奖项~
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《神秘视线:破碎的时钟(Mystery Case Files: Broken Hour)》是Big Fish Games制作发...
它也允许你在触控板与数字小键盘之间切换,所以并不会影响到触控板的常规操作。
与以往一样,两款 Metropolis 系列 iPad Pro 保护壳符合 MIL-SPEC 810G 美国军用防护...
苹果的Smart Keyboard?其他厂商带智能连接器的?还是蓝牙键盘?
消费者只能通过苹果在线商店和苹果零售店去购买新版产品。
从命名的方式来看,这 3 款保护壳应该是主打保护性能。
该设备可直接绕过智能手机及设备上的配套 App 便可进行对智能家居设备的操控。
在无线耳机这个重要的电子消费领域,来自其他厂商的竞争可不会小。
由于更偏向于暖色调,灯泡比较适合作为卧室、休息室、厨房、客厅的装饰灯。
求一款可以把扫描后的文件转换为文本格式的APP!
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白苹果, 积分 967, 距离下一级还需 533 积分
本帖最后由 Asanowang2010 于
11:43 编辑
求大神推荐:可以把拍照后的图片文件转换为文本格式的APP!
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大神在哪里啊?
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有的,ocr文字识别
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扫描直接识别的,都不是很准确,错误很多。建议使用扫描宝,扫描成PDF,在电脑上用PDF转word软件,把文字转出来,准确率要高很多。
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白手起家, 积分 22, 距离下一级还需 178 积分
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本帖最后由 小风0000 于
11:13 编辑
求大家给个流程,怎么解决这个问题?找了好久还是解决不了。
按本人的想法是,把dat2做成个矩阵,然后对dat1文件进行迭代,每次按da2进行替换。但是第一步就出现问题:怎么读入数据,转换成矩阵?
ind1& & & & 2202220
ind2& & & & 2222002
ind3& & & & 2222002
ind4& & & & 1221102
ind5& & & & 2222002
ind6& & & & 2212111
ind7& & & & 2202210
ind8& & & & 1221102
ind9& & & & 2222002
ind10& & & & 2222002
SNPID_600K,Allele_0,Allele_1
dat1有10000行,2列,第2列有428896个数字。
dat2有428896行,3列。
现在要根据dat1第2列的数字转换成字符,以dat1的第2列的第1个数字为例,数字2按dat2里的第3列转换成C C。如果数字为1则按第2和第3列,转换成A C。如果数字为0,则按第2列转换成A A。
最后输出的格式为:
ind1 C C G G A A C C C C C C A A
ind2 C C G G G G C C T T T T G G
&&nbsp|&&nbsp&&nbsp|&&nbsp&&nbsp|&&nbsp&&nbsp|&&nbsp
家境小康, 积分 1483, 距离下一级还需 517 积分
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本帖最后由 Hadron74 于
08:30 编辑
一看你也是学生物信息的。
按我的理解,dat1的列应该对应dat2的行吧,所以你的输出格式的例子有误。
如果这样,程序如下:dat1 = &&&ind1& && &&&2202220
ind2& && &&&2222002
ind3& && &&&2222002
ind4& && &&&1221102
ind5& && &&&2222002
ind6& && &&&2212111
ind7& && &&&2202210
ind8& && &&&1221102
ind9& && &&&2222002
ind10& && &&&2222002&&&
dat2 = &&&snp1,A,C
snp2,A,G
snp3,A,G
snp4,T,C
snp5,T,C
snp6,T,C
snp7,A,G&&&
snps = []
for line in dat2.split(&\n&):
& & snp,a0,a2=line.rstrip().split(&,&)
& & snps.append((a0,a2))
d1={}
import re
for line in dat1.split(&\n&):
& & ind,values =re.split(&\s+&,line.rstrip())
& & bases = []
& & for i, v in enumerate(values):
& && &&&s = snps[i]
& && &&&if v == &1&:
& && && && &bases.append(s[0])
& && && && &bases.append(s[1])
& && &&&elif v == &2&:
& && && && &bases.append(s[1])
& && && && &bases.append(s[1])
& && &&&elif v == &0&:
& && && && &bases.append(s[0])
& && && && &bases.append(s[0])
& && &&&else:
& && && && &raise ValueError(&Not valid number: & + v)
& & d1[ind]=bases
print &ind1&,& &.join(d1[&ind1&])
print &ind2&,& &.join(d1[&ind2&])
复制代码ind1 C C G G A A C C C C C C A A
ind2 C C G G G G C C T T T T G G复制代码错别字太多了,看着费劲。
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我也是生物信息的,这个转换竟然看不懂呢
家境小康, 积分 1483, 距离下一级还需 517 积分
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应该是把alleles 的结果转换成类似plink的ped格式输入的数据转换。
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二楼对的就好回复
白手起家, 积分 22, 距离下一级还需 178 积分
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谢谢,确实输出格式给错了,已经修改过来了。谢谢您的帮忙,我仔细看了您的代码。解决问题了!
白手起家, 积分 134, 距离下一级还需 66 积分
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& &现在搞生物的写代码都这么牛了啊?
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逼着自己学的,除非是那种后来转生物的,本来学生物的,后来学coding的,都比较苦逼,相对来说python简单一点回复
beacon1024
白手起家, 积分 22, 距离下一级还需 178 积分
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是的,自学很痛苦啊。大神,刚开始学,还有个问题请教下:
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求救,如何将xyz格式的文件转化为可以让lammps读的data文件,求大神,感激不尽 。
我现在是有一份石墨烯的xyz文件,我需要把它设置成为lammps能够识别的data文件就可以了,。不知道应该用什么办法?
应该怎么做?有教程么?
就是一个石墨烯的坐标模型,都是c原子,。。。
仅仅.xyz转过去是不完整的(见下),还有bond, angle, dihedral的定义。
--------------
function xyz2lmp(f_xyz)
% This script converts .xyz file to lammps data file.
%& &f_xyz: name of the input .xyz file.
% Example:
%& &xyz2lmp('PdAu.xyz')
% NOTE: The second line must be in specified format as:
%& &PdAu xlo xhi ylo yhi zlo zhi
% Poweed by Xianbao Duan
% Website: http://www.52souji.net/
% open the .xyz file
fidin = fopen(f_xyz,'r');
if fidin == -1
& & error('Failed to open the file. Please check!');
% number of all the atoms
atom_num_a = fscanf(fidin,'%d');
comment = textscan(fidin,'%s %f %f %f %f %f %f',1);
xlo = comment{2};
xhi= comment{3};
ylo = comment{4};
yhi= comment{5};
zlo = comment{6};
zhi= comment{7};
% coordinates of the atoms
atoms = textscan(fidin,'%s %f %f %f',atom_num_a);
fclose(fidin);
% initialize
type_name = atoms{1}(1);& & % names of types
atom_num(1) = 1;& && && && &% atom number of each type
% sort the atoms according to their types
for i = 2: length(atoms{1})
& & flag = 0;
& & for j = 1:length(type_name)
& && &&&if strcmp(atoms{1}(i),type_name(j)) == 1
& && && && &atom_num(j) = atom_num(j) + 1;
& && && && &flag = 1;
& && && && &
& && &&&end
& & if flag == 0
& && &&&type_name(end+1) = atoms{1}(i);
& && &&&atom_num(end+1) = 1;
type_num = length(type_name);
% write the lammps file
outfilename = strrep(f_xyz,'.xyz','.lmp');
fidout = fopen(outfilename, 'w');
new_comment =&&;
fprintf(fidout,'%s\n\n',new_comment);
fprintf(fidout,'%d \t %s\n',atom_num_a,'atoms');
fprintf(fidout,'%d \t %s\n',type_num,'atom types');
fprintf(fidout,'%f&&%f \t%s\n',xlo,xhi,'xlo xhi');
fprintf(fidout,'%f&&%f \t%s\n',ylo,yhi,'ylo yhi');
fprintf(fidout,'%f&&%f \t%s\n\n',zlo,zhi,'zlo zhi');
fprintf(fidout,'%s\n\n','Atoms');
% the data
for i = 1:length(atoms{1})
& & for j = 1:type_num
& && &&&if strcmp(atoms{1}(i),type_name(j)) == 1
& && && && &fprintf(fidout,'%d \t %d \t %f \t %f \t %f \n',...
& && && && && & i,j,atoms{2}(i),atoms{3}(i),atoms{4}(i));
& && && && &
& && &&&end
fclose(fidout);
你这个in文件是lammps官网的那个例子吧?我现在就在研究这个in文件啊。我有很多疑问,如果你方便,可以加我q详谈么, 很需要你的帮助,谢谢。
我的这个问题也就是看这个文件遇到的。因为运行不下去了。
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求真正的视频格式转换大神~收藏
亲,请帮我一下。我很喜欢一个视频,但是我不会转换,真的是智商有限啊,我只会格式工厂这一类的,视频是AVI格式,但是我想转换成BIK格式,这种格式不大好弄,我下了3次,都转换不成,也是我技术真的不好,总之,现在期望有会的大神帮我这个忙,万分感谢了,么么哒视频来自:这个就是视频,希望转成BIK格式,虽然机会可能很渺茫,但是还是试一试吧,或许真的有热心人呢,是吧,我的邮箱是:。
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