福建中部3个野生蕉自然居群基于NTSYS和STRUCTURE软件的ISSR分析--《热带作物学报》2014年02期
福建中部3个野生蕉自然居群基于NTSYS和STRUCTURE软件的ISSR分析
【摘要】：为进一步完善福建野生蕉遗传背景研究,对采自福建省三明市和福州市的3个野生蕉自然居群共100份叶片样本进行ISSR分析,并结合NTSYS、STRUCTURE和POPGENE等软件,进行居群遗传结构和遗传多样性分析。结果表明:13条引物共扩增获得175个稳定、清晰的条带,平均扩增条带数为13.5个,扩增产物主要介于200~2 000 bp,其中总的多态性条带为158个,居群总多态性条带百分率为90.3%;通过NTSYS和STRUCTUR软件聚类分析发现,岩前、莘口和赤壁野生蕉共100份样本严格按照地理来源划分为3个大组,3个大组可进一步分别划分为3、3和4个亚组;采用POPGENE进行遗传多样性参数分析发现,野生蕉居群总的变异中,群体内变异大于群体间变异,野生蕉居群内存在丰富的基因交流,3个野生蕉居群总体多样性水平较高,从高到低依次为岩前、莘口和赤壁。说明福建野生蕉居群遗传结构具有相对独立的特点,水和人为因素在野生蕉群体演变过程中具有重要影响。
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【分类号】：S668.1【正文快照】：
香蕉是芭蕉科(Musaceae)芭蕉属(Musa)大型单子叶草本植物,栽培香蕉主要分布于热带亚热带地区,是全世界重要的水果,也是热带亚热带地区重要的食物来源[1]。品种退化且单一[1]、病虫害侵扰[2-3]、育种进程缓慢[4]、自然灾害频发[5]是香蕉栽培的世界性问题,加快香蕉育种进程、选
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[NTSYS PC软件功能开发(引物,条带,聚类分析,矩阵)] 我现在正在用NTSYS对水稻(Rice)的AFLP结果进行聚类分析，将AFLP的条带转化成0-1矩阵进行分析，用不同AFLP引物得到的树状图差别很大。为了使结果更接近“真理”，该软件对引物的选择是不是有要求，该软件可不可以将多对引物的结果同时输入，进行叠加，然后得到比较精确的结果呢？有没有这样的参数设置，或者有没有此类更好的软件？请您不吝赐教！ 关键词:[引物 聚类分析 条带 矩阵 参数设置 树状图]…
我现在正在用NTSYS对水稻(Rice)的AFLP结果进行聚类分析，将AFLP的条带转化成0-1矩阵进行分析，用不同AFLP引物得到的树状图差别很大。为了使结果更接近“真理”，该软件对引物的选择是不是有要求，该软件可不可以将多对引物的结果同时输入，进行叠加，然后得到比较精确的结果呢？有没有这样的参数设置，或者有没有此类更好的软件？请您不吝赐教！
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