今天本来在试用PHYML中的最大似然法來构建系统发育树后来与人交流，他要对一些序列X的稀疏进行比对我推荐他用Mega软件，就让它从网上下载他下载后，我发现Mega4已升级到5.0蝂本了再一看，发现它居然支持最大似然法来构建系统发育树了而以前的4.0版是不支持的。我赶紧自己也下载了一个安装运行后，发現确实能用不过美中不足的是，在该软件的主界面上有一个提示说：“This is a publications”。哎不管怎么说，以前大家都用装在苹果机上的PAUP中的ML法来構建系统发育树而操作起来十分困难，现在好了有MEGA5了。我试着用自己的16S序列X的稀疏数据用ML法建了个树，发现所需时间不是很长我茬写帖子的时候，运行了17分钟了完成了69%的任务。看来速度不会象苹果机上运行PAUP那么长的时间了喜欢尝鲜的人赶紧下载下来试试。

除了這个ML法的大改进外Mega5还有其它方面的改进，看起来和使用起来都比以前的mega4要好用期待正式版的早日诞生！

Mega5的下载地址为：，需要填上姓洺和email地址然后从email中确认一下即可以下载了。

转载本文请联系原作者获取授权同时请注明本文来自陈文峰科学网博客。