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&这种图是用什么软件做的？？？
这种图是用什么软件做的？？？
作者 audiencewill
这两张图是用什么软件画的谢谢。
Diamond，Materials Studio都可以做啊，另外这个图可能是做计算算出来的。祝好，
我觉得可以先画一个小晶胞，然后设置晶胞数
应该是用Crystalmake画的
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(小有名气)
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请问这种序列比对图是用什么软件做的呢？已有3人参与
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引用回帖:: Originally posted by Huobol at
试了下BioEdit，通过导入Fasta格式的序列，依次单击Accessory Application-ClustalW Multiple alignment，单击Option-Edit Color Table，给每个氨基酸字母设置为黑色，也就是去掉彩色，再单击Shade identities and ... 不好意思，没有看清上图还有75%相似的氨基酸，这种情况可以用在线网站UniProt，非常简单快捷，在主页上有一个Sequence alignment, 点击进入之后，将你想要比对的蛋白质序列的fasta文件粘贴进去。选择Run align,就会出来结果。在左边有一个Similarity选项，打钩之后就会出现大家想要的完全一样是黑色，相似度75%和50%等等是稍灰的颜色。本来想插入图片展示一下，但是本人新手，不知怎么操作，如有疑问，可以相互交流。
(小有名气)
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【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ 感谢参与，应助指数 +1zeroon: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢啦
楼上比你早一点，先给他了一朵花
最简单的就是DNAMAN软件，序列比对-添加序列-比对-分析-输出-比较结果
然后再用PS或者AI再添加相应描述
(正式写手)
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虫号: 1214385
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【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ zeroon: 金币+2, ★★★很有帮助
00:11:49渊博震天: 金币+5, 鼓励积极回帖交流
1、序列导入：
打开DNAman软件，单击channel1以激活通道1，再单击file-open或者文件夹图标以浏览电脑文件，选择所有文件方可显示电脑中之前存储的fasta或txt格式的文件，选中要导入的文件后（注意导入通道内的序列是fasta格式的即带大于号形式的序列），再依次单击channel2、3、4……依次导入其他fasta格式的蛋白序列。
2、比对分析：
单击Sequence-Multiple sequence alignment，选择protein，单击channel，选择所有要比对的channel，OK后单击下一步，选择Fast alignment，单击下一步，选择默认的Quick alignment（如果前面没有选择Fast alignment，则这一步选择Dynamic alignment），单击完成。
3、设置Option
单击Options-Shading homology，在Shading type里设置相应颜色，单击确定。另外，Options-Preference里选项可做调整，比如勾选No pos label in Printing/Output则不出现氨基酸的个数标示，比如不勾选Show consensus sequence，则不出现一致序列，这样既美观又有了更多的空间去标示motif等。
4、输出图片
单击Output-Graphic (EMF) File，即导出图片格式的比对文件。
我的Win7 32系统在DNAman8和9版本都没成功安装，可能是32位的原因，7版本安装成功，但单击完成就闪退了，所以做不出结果。还好另一个电脑Win10 64系统，安装DNAman9版本相对稳定，但也出现了闪退的情况。
让羽毛再飞一会儿
(初入文坛)
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引用回帖:: Originally posted by Huobol at
第一个问题，给Similarity选项打钩之后并没有完全保证灰色，比如我比对3条序列，有的两个氨基酸一样的是灰色，但还有不少两个一样的并没有标记灰色，需要怎么设置，望说明下？
第二个问题，UniProt怎么导出这种 ... 你好，感谢提出问提，共同进步。
第一，在比较多条序列时，Uniprot 是根据Clustal Omega程序原则比对的，具体我也不太清楚，如果有两个一样的并没有标记灰色，应该是总体来说，这两个氨基酸和其他序列该位置的氨基酸相似性太小，不具有比对效果；楼主贴出的图片中也有这种情况
第二，可以直接截图下来，以图片保存，好像不能下载
(初入文坛)
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虫号: 2134973
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【答案】应助回帖
★ ★ ★ zeroon: 金币+2, ★有帮助
15:24:58zeroon: 金币+1, ★有帮助
我用的BioEdit，很简单方便。也可以自己修改编辑。
(正式写手)
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引用回帖:: Originally posted by songshande at
我用的BioEdit，很简单方便。也可以自己修改编辑。 试了下BioEdit，通过导入Fasta格式的序列，依次单击Accessory Application-ClustalW Multiple alignment，单击Option-Edit Color Table，给每个氨基酸字母设置为黑色，也就是去掉彩色，再单击Shade identities and similarities in alignment window图标或者单击View-View mode-identity/similarity shading，会给一致的序列加上黑色背景。
但一致性50%或75%怎么加灰色背景？就是楼主发的图片里的灰色背景，请赐教，谢谢！
让羽毛再飞一会儿
(正式写手)
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引用回帖:: Originally posted by songshande at
不好意思，没有看清上图还有75%相似的氨基酸，这种情况可以用在线网站UniProt，非常简单快捷，在主页上有一个Sequence alignment, 点击进入之后，将你想要比对的蛋白质序列的fasta文件粘贴进去。选择Run align,就会 ... 第一个问题，给Similarity选项打钩之后并没有完全保证灰色，比如我比对3条序列，有的两个氨基酸一样的是灰色，但还有不少两个一样的并没有标记灰色，需要怎么设置，望说明下？
第二个问题，UniProt怎么导出这种黑色灰色标记的图片？（网址上有如何打印彩色图的连接，但跟这个应该无关）
如果这两个问题不能很好解决的话，还是DNAman更好一些。
让羽毛再飞一会儿
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DNAman 和DNAstar 都可以的，DNAstar 还可以设置密码子偏好
科研路上无坦途
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鱼与熊掌不可兼得
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送红花一朵
引用回帖:: Originally posted by wenyi1991113 at
DNAman 谢谢啦
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解决的办法。
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目前我们的生活水平必竟非同以往．吃得好休息得好，能量消耗慢，食欲比较旺盛，活动又少，不知不觉脂肪堆积开始胖啦。　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　减肥诀窍：一．注意调整生活习惯，二。科学合理饮食结构，三。坚持不懈适量运动。
　　　具体说来：不要暴饮暴食。宜细嚼慢咽。忌辛辣油腻，清淡为好。多喝水，多吃脆平果青香焦，芹菜，冬瓜，黄瓜，罗卜，番茄，既助减肥，又益养颜，两全其美！
有减肥史或顽固型症状则需经药物治疗．
如有其他问题，请发电子邮件:jiaoaozihao53@ .或新浪QQ: 1
销售额：指企业在销售商品、提供劳务及让渡资产使用权等日常活动中所形成的经济利益的总流入。税法上这一概念是不含任何税金的收入。销售额适用于制造业、商业等。
营业额会计上指的是营业收入，税法指的是应税营业收入。营业额属于含税收入，适用于饮食业、运输业、广告业、娱乐业、建筑安装业等 。
考虑是由于天气比较干燥和身体上火导致的，建议不要吃香辣和煎炸的食物，多喝水，多吃点水果，不能吃牛肉和海鱼。可以服用（穿心莲片，维生素b2和b6）。也可以服用一些中药，如清热解毒的。
确实没有偿还能力的，应当与贷款机构进行协商，宽展还款期间或者分期归还； 如果贷款机构起诉到法院胜诉之后，在履行期未履行法院判决，会申请法院强制执行； 法院在受理强制执行时，会依法查询贷款人名下的房产、车辆、证券和存款；贷款人名下没有可供执行的财产而又拒绝履行法院的生效判决，则有逾期还款等负面信息记录在个人的信用报告中并被限制高消费及出入境，甚至有可能会被司法拘留。
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