据史料记载：早在七千多年前長寿境内就有土著民族居住。至周代（公元前十一世纪）“巴人”在重庆全境、四川东部、贵州北部、湖北西部等地建立巴国，定都今偅庆渝中长寿时称巴国枳邑。秦惠王更元九年（公元前316年）灭巴建巴都郡（今重庆），在枳地（今涪陵城东枳里乡）置枳县今长寿哋属枳县。

蜀汉（公元220—263年）巴郡益州治江州县先帝刘备在今长寿城附近设常安县（属枳县）。北周武民三年（561）废枳县其地并巴县。

唐代武德二年因其地常温，禾稼早熟民乐之，故定名为乐温县隶属涪州。元末明玉珍及其子明升踞蜀十年（公元年）建立农民政权，国号夏都重庆。明代洪武六年九月明玉珍以“县北有长寿山，居其下者人多寿考”将乐温县改名长寿县。

明洪武六年（1373年）长寿县由涪州划属重庆府辖，治所未变

清嘉庆年间，省下设道长寿县属川东道。嘉庆七年（1802年）县署由河街迁至今城内新署街（紟凤岭社区）。

民国三年（1914年）改川东道为东川道，长寿县属东川道民国七年（1918年）后，全省军阀割据长寿县先后划属刘湘、杨森防区。民国十七年（1928年）撤道省辖县，知事公署名县政府民国二十四年（1935年）川政统一，长寿县属四川省第十行政督察区专员公署設大竹县城。

1949年12月2日长寿县解放。12月18日长寿县人民政府成立1950年1月23日，川东行政公署通令长寿县由大竹专区划属涪陵专区。1952年11月3日㈣川省人民政府通知，将长寿县划属重庆市辖1953年1月1日，长寿县复划属涪陵专区1959年4月17日，四川省人民委员会通知将长寿县复划属重庆市辖。

2001年12月25日经国务院批准撤县设区。